ADN environnemental
- L’ADN environnemental, fascinante technique pour découvrir des espèces marines, Magali Reinert (Reporterre)
- Benchmarking bioinformatic tools for fast and accurate eDNA metabarcoding species identification (Mathon et al, 2021)
- Uso de ADN Ambiental en la Evaluación de la Diversidad Funcional y Filogenética de los Peces (Marquez et al, 2021)
- Environmental DNA metabarcoding reveals and unpacks a biodiversity conservation paradox in Mediterranean marine reserves (Boulanger 2021)
- GAPeDNA: Assessing and mapping global species gaps in genetic databases for eDNA metabarcoding (Marques et al, 2021)
- Ecological indicators based on quantitative eDNA metabarcoding: the case of marine reserves (Sanchez et al. 2022)
- Global Ecology and Biogeography – The distribution of coastal fish eDNA sequences in the Anthropocene (Mathon et al, 2023)
- An environmental DNA assay for the detection of Critically Endangered angel sharks (Squatina spp.) ( et al., 2023)
- Benchmarking fish biodiversity of seaports with eDNA and nearby marine reserves (Manel et al., 2024).
- The Tree of Live eDNA metabarcoding reveals a similar taxonomic richness but dissimilar evolutionary lineages between seaports and marine reserves (Macé et al., 2024).
- Guide d’utilisation de l’ADNe – milieu marin (2024)
- User guide to environmental DNA in marine environments (2025)
Herbiers à Phanérogames
Herbiers à posidonie
- Underwater acoustic positioning systems as tool for Posidonia oceanica beds survey (Descamp et al., 2005)
- Ecological status assessment using P. oceanica (PREI) (Gobert et al., 2009)
- Acoustic telemetry for monitoring P. oceanica (Descamp et al., 2010)
- A biotic index using P. oceanica (BiPo) (Lopez Y Royo et al., 2010)
- An Ecosystem-Based Approach to Assess the Status of a Mediterranean Ecosystem (EBQI) (Personnic et al., 2014)
- Impact of 85 years of coastal development on seagrass beds (Holon et al., 2015)
- Posidonia ecosystem services economical value (Campagne et al., 2015)
- Monitoring Marine Habitats With Photogrammetry (Marre et al., 2019)
- et al., 2020)
- Impact des pressions anthropiques et de l’environnement sur les herbiers de Posidonia oceanica en Méditerranée française (Houngnandan, 2020)
- Développement de la photogrammétrie et d’analyses d’images pour l’étude et le suivi d’habitats marins (Marre, 2020)
- Fine-scale automatic mapping of living Posidonia oceanica seagrass beds with underwater photogrammetry (Marre et al., 2020)
- Préservation des posidonies: les ressorts d’une collaboration efficace (Deter et al., 2022)
- Earth observation for ecosystem accounting: spatially explicit national seagrass extent and carbon stock in Kenya, Tanzania, Mozambique and Madagascar (Traganos et al., 2022)
- Assessing Seagrass Restoration Actions through a Micro-Bathymetry Survey Approach (Italy, Mediterranean Sea) (Rende et al 2022).
- Early signals of Posidonia oceanica meadows recovery in a contexte of wastewater tratment improvements, (Bockel et al 2024).
- Gigantic breeding colonies of a marine fish in the Mediterranean, (Deter et al 2024).
- Bockel T, Bossut N, Mouquet N, et al (2024) Quantifying the impact of small boats on Posidonia seagrass meadows: Methods and path for future efficient management of anchoring pressure. Ocean & Coastal Management 259:107454.
- Pergent-Martini C., Andr S., Castejon I., Deter J., Frau F., Gerakaris V., Mancini G., Molenaar H., Montefalcone M., Oprandi A., Pergent G., Poursanidis D., Royo L., Terrados J., Tomasello A., Ventura D., Villers F. (2024). Guideline for the active restoration of Posidonia oceanica.
- Descamp P., Personnic S., Gobert S., Boulenger A., Leduc M., Delaruelle G., Barroil A., Marre G., Holon F., Deter J. (2025). Seagrass sod transplantation: A relevant tool for preventing the destruction of meadows in coastal construction projects. Environmental Challenges. 101087.
Autres Herbiers
Pollution marine – Rejets urbains
Pressions anthropiques
- Impact of 85 years of coastal development on seagrass beds (Holon et al., 2015a)
- Fine-Scale Cartography of Human Impacts along French Mediterranean Coasts (Holon et al., 2015b)
- Interactions entre écosystèmes marins et pressions anthropiques (Holon 2015)
- Boat anchoring pressure on coastal seabed using AIS data (Deter et al., 2017)
- A predictive model based on coastal anthropogenic pressures (Holon et al., 2018)
- Impact des pressions anthropiques et de l’environnement sur les herbiers de Posidonia oceanica en Méditerranée française (Houngnandan, 2020)
- Anchoring pressure and the effectiveness of new management measures quantified using AIS data and a mobile application. Marine Pollution Bulletin (Bockel T, Marre G, Delaruelle G, et al, 2023)
- Bockel T, Bossut N, Mouquet N, et al (2024) Quantifying the impact of small boats on Posidonia seagrass meadows: Methods and path for future efficient management of anchoring pressure. Ocean & Coastal Management 259:107454.
- Une approche innovante de l’étude et de la gestion des pressions anthropiques et de leurs impacts sur les écosystèmes marins côtiers de Méditerranée française (Thomas Bockel, 2025)
Récifs coralligènes
• A Visual Basic program for the determination of coral and substrate coverage (Kohler & Gill 2006)
• New multidimensional functional diversity indices (Villéger et al., 2008)
• An index based on coralligenous assemblages : CAI (Deter et al., 2012)
• A photographic method detects depth gradient in coralligenous (Deter et al., 2012)
• Mapping biodiversity in three-dimensions challenges marine conservation strategies (Doxa et al., 2015)
• Fine-Scale Cartography of Human Impacts along French Mediterranean Coasts (Holon et al., 2015)
• Interactions entre écosystèmes marins et pressions anthropiques (Holon 2015)
• Taxonomic and functional diversity increase the aesthetic value of coralligenous reefs (Tribot 2016)
• Esthétique et Biodiversité des écosystèmes sous-marins (Tribot 2017).
• Integrating the aesthetic value of landscapes and diversity (Tribot et al., 2018)
• Deep convolutional neural networks to monitor coralligenous (Marre et al., 2020).
Cartographie des habitats
- • Cartographie evolutive des herbiers de Posidonie, region PACA (Andromede, 2013)
- • La Mediterranée dévoile ses dessous (Andromède Océanologie & AERMC, 2014)
- • A predictive approach to benthic marine habitat mapping (Vassallo et al., 2018)
- • Atlas de synthèse 2020 – Surveillance biologique et Qualité des eaux de Méditerranée (Andromède Océanologie & AERMC, 2020)
- • Atlas de synthèse 2024 – Surveillance biologique et Qualité des eaux de Méditerranée (Andromède Océanologie & AERMC, 2024)
- • Cartographie et analyse surfacique des habitats marins – Actualisation 2016 à 2018 (Littoral Corse)
- • Cartographie et analyse surfacique des habitats marins – Actualisation 2018 (Région Sud) (Andromède Océanologie, 2018)
- • Cartographie et analyse surfacique des habitats marins (SURFSTAT) et réseau de suivi des pressions anthropiques côtières (IMPACT) – Mise à jour 2020 – 2021 (Région Sud) (Andromède Océanologie, 2021)
- • Cartographie et analyse surfacique des habitats marins – Poursuite de la mise à jour en Région Sud (2020-2021) (Andromède Océanologie, 2024)
- Cartographie et analyse surfacique des habitats marins en région Corse – Actualisation 2024 (Andromède Océanologie, 2024)