PISCIS

RESEAU DE SURVEILLANCE PAR LE SUIVI DES ASSEMBLAGES ICHTYOLOGIQUES

PISCIS est le réseau de suivi des assemblages ichtyologiques opéré depuis 2015 par Andromède Océanologie avec le soutien de l’Agence de l’eau Rhône Méditerranée et Corse. La caractérisation des assemblages ichtyologiques est réalisée par campagne régionale annuelle sur la période mi-mai/fin juin, sur l’ensemble de la façade méditerranéenne française bordée par les trois régions : Corse, Provence-Alpes-Côte d’Azur (PACA) et Occitanie.

La méthode choisie pour la caractérisation des assemblages ichtyologiques entre 2015 et 2019 est une acquisition vidéo réalisée à partir de quatre GoPro offrant un champ de vision à 360°. Pour chaque site et chaque habitat (chaque station), trois blocs vidéo espacés de quelques dizaines de mètres sont immergés pour une durée d’acquisition de 10 minutes. Les poissons sont comptés par visionnage des vidéos. Cent quatre-vingt-six stations ont été échantillonnées par cette méthode, en parallèle des réseaux de surveillance RECOR (suivi des récifs coralligènes et TEMPO (surveillance de l’herbier à Posidonie). Une plaquette descriptive de cette méthode vidéo 360° est disponible sur la plateforme MEDTRIX, projet PISCIS.

Depuis 2020, la méthode utilisée a changé pour laisser place à l’ADN environnemental. Soixante-quinze stations ont ainsi pu être échantillonnées dans le cadre du PISCIS sur les trois régions de Méditerranée française entre 2020 et 2023 (16 stations en 2020, 13 en 2021, 30 en 2022 et 16 en 2023). Parmi ces stations, 37 correspondaient à l’habitat Herbier de posidonie (sites TEMPO) et 38 à l’habitat récifs coralligènes (sites RECOR). La caractérisation des peuplements de poissons par ADNe continue en 2024, 2025 et 2026 pour 58 stations PISCIS. Ainsi, 28 sites de récifs coralligènes et 30 stations d’herbier de posidonie (-15 mètres) seront échantillonnés dans le cadre du marché de la surveillance biologique des eaux côtières des bassins Rhône Méditerranée et Corse lancé par l’Agence de l’eau.

La collecte des échantillons d’ADN environnemental est réalisée à l’aide d’une technique permettant la filtration de 30 litres d’eau à travers une capsule de filtration à pores de 0,2 µm. Les kits VigiDNA DW2, intégrant les consommables nécessaires pour l’échantillonnage et notamment un tuyau muni d’une crépine, une capsule de filtration à très faible porosité (0,2 µm) et un tampon de conservation de l’ADN (CL1), sont utilisés. Pour chaque site de surveillance deux kits sont utilisés (soit deux échantillons par site). Les prélèvements sont réalisés à l’aide d’une pompe étanche déposée sur le fond. Une plaquette descriptive de cette méthode ADNe est disponible sur la plateforme MEDTRIX, projet PISCIS.

Un outil de comparaison des stations existe dans ce projet. Cet outil permet de comparer les différentes métriques calculées et ce à différentes échelles spatiales de comparaison (Méditerranée, Région, Masse d’eau côtière). Vous pouvez visualiser tous les résultats directement sur la plateforme, en cliquant sur le bouton « Accéder aux cartes« , juste en-dessous.

Pour les suivis par ADNe (à partir de 2020), l’analyse des espèces identifiées permet d’établir différents indicateurs comme l’indicateur de richesse spécifique, l’indicateur de diversité fonctionnelle des poissons, le Large Reef Fish Inidicator, l’indicateur crypto-benhtique, l’indicateur thermique des poissons… Ces nouveaux indicateurs sont établis par l’UMR MARBEC (Université de Montpellier) et Andromède.

Contact : Thomas Bockel

Porteur du projet : Andromède Océanologie   –  andromede-ocean

Fréquence d’actualisation : Un suivi annuel par région (chaque région, Occitanie/PACA Ouest, PACA Est et Corse, est suivie tous les trois ans).

Partenaire : Agence de l’eau Rhône Méditerranée

Rapports d’études